Нарвская кафедра была учреждена решением Святейшего Синода 24 апреля 1887 года как викариатство Санкт-Петербургской митрополии, и просуществовала до 1926 года. При вхождении в 1923 году Эстонской православной церкви под юрисдикцию Константиноп ольского Патриархата в ней было учреждено три самостоятельные епархии: Таллинская, Нарвская и Печерская.

В 1941  году Эстонская православная церковь возвратилась в юрисдикцию Московского Патриархата и, хотя она вторично во время Второй мировой войны была подчинена Константинопольской юрисдикции, епископ Нарвский Павел (Дмитровский) сохранил единство с Московским Патриархатом.

После 1945  года кафедра оставалась вдовствующей.

27 мая 2009 года решением Священного Синода РПЦ, учреждена должность викарного епископа, на каковую был определён наместник Иоанно-Богословского Макаровского монастыря города Саранска архимандрит Лазарь (Гуркин) (хиротония совершена 21 июля 2009 года).

30 мая 2011  года ходатайством митрополита Таллинского и всея Эстонии Корнилия и решением Священного Синода Русской Православной Церкви образована Нарвская епархия в составе Эстонской Православной Церкви Московского Патриархата в границах города Нарва, волостей Вайвара, Иллука, Алайыэ, Ийзаку, Тудулинна, Лохусуу (уезд Ида-Вирумаа), волостей Торма, Касепяя, Пала (уезд Йыгевамаа), волости Алатскиви (уезд Тартумаа).